Enfermé depuis 25 ans dans la Loge Noire, l'esprit de l'agent special Dale Cooper reçoit un nouveau message du Géant : Bob, l'esprit démoniaque qui s'est emparé de son corps, va se manifester à nouveau. Pendant ce temps, sur Terre, Mr. C, le double maléfique de l'agent, continue de semer le chaos, avec l'aide d'une bande de malfrats. À New York, au dernier étage appartenant à un milliardaire, un étudiant est chargé de surveiller une étrange boîte en verre toute la journée.
Épisode 1
Vingt-cinq ans après la mort bouleversante de Laura Palmer, sauvagement assassinée à Twin Peaks, la question reste entière : qui a tué la reine du lycée ?
Épisode 2
Phyllis, la femme de Bill Hastings, l'accuse d'entretenir une liaison extra-conjugale. Elle-même trompe son mari avec George, l'avocat de Bill.
Épisode 3
Cooper se retrouve dans un bâtiment en tôle, où deux femmes apparaissent pour le protéger d'une entité invisible, mais menaçante. Son double fait un accident.
Épisode 4
Au casino, Cooper remporte 29 fois consécutives le jackpot, soit 425 000 dollars, puis est raccompagné chez Dougie. Il se glisse dans la vie de celui-ci.
Épisode 5
Janey-E dépose Cooper sur le lieu de travail de Dougie, où il est intrigué par une statue posée à l'extérieur, mais aussi par l'odeur du café.
Épisode 6
La police trouve Cooper en train de vagabonder près de son bureau et l'emmène dans la maison de Dougie. Janey-E reçoit une photo de son mari avec Jade.
Épisode 7
Hawk et Frank Truman examinent des pages du journal intime de Laura. Sur une page, elle décrit un rêve dans lequel Annie lui parle de Dale, prisonnier de la loge.
Épisode 8
Le double de Cooper menace Ray et tente de lui soutirer des informations. Celui-ci lui tire dessus.
Épisode 9
Le double de Cooper arrive à la ferme, où il rencontre Hutch et Chantal, qui ont tué les fermiers. Il envoie un message à Diane et appelle Duncan.
Épisode 10
Richard Horne demande des explications à Miriam. Celle-ci lui explique qu'elle a écrit au shérif Truman pour lui dire la vérité sur le délit de fuite.
Épisode 11
Un groupe d'enfants découvre Miriam en train de ramper dans les sous-bois. Becky apprend que son mari Steven la trompe avec Gersten Haward.
Épisode 12
Gordon et Albert décident d'intégrer Tammy et Diane au sein du projet Blue Rose. Sarah Palmer est témoin d'une scène très inquiétante dans une supérette.
Épisode 13
Dougie rentre à la maison, des cadeaux sous le bras. De son côté, Anthony s'engage dans une mission périlleuse. Le double de Cooper cherche à prendre sa revanche...
Épisode 14
Frank informe Gordon que des pages trouvées dans le journal de Laura suggèrent l'existence de deux Coopers. Albert parle à Tammy de l'affaire de la Rose bleue.
Épisode 15
Le double de Cooper arrive au magasin pour demander à Jeffries, qui a pris l'apparence d'une étagère en métal, des informations sur la tentative d'assassinat.
Épisode 16
Le double de Cooper et Richard suivent les coordonnées géographiques qu'ils ont obtenues, alors que Jerry Horne les observe. Richard arrive le premier
Épisode 17
Cole parle à Albert de l'entité d'une force négative extrême, connue sous le nom de «Judy», et du plan élaboré avec Cooper et Jeffries pour la retrouver.
Épisode 18
Le double de Cooper brûle dans la Salle rouge et MIKE crée un nouveau Dougie Jones, qui retrouve Janey-E et Sonny Jim. Cooper réapparaît dans la Salle rouge.